А почему не рассматривается вариант "нормальной" приемки товара с разноской накладной? Счета то можно и забалансные настроить. Если номенклатура не пересекается с основной - то и проблем нет. Если пересекается - то, возможно, нужны доработки по подбору счетов разноски на основании, например, склада.
Ну или посмотрите как сделана складская аналитика "Профиль учета" в AX 2009 - она в будущем развитии системы будет использована в том числе для Ответ. хранения. Если время терпит - можно подождать и "решение" от Microsoft
