Есть AddOn к Navision - XML-DEM, с помощью его можно организовывать выгрузку и загрузку в XML формате. Для него созданы шаблоны обмена с разными программами, в том числе есть и для 1С. В отличии от работы напрямую с базой в XML-DEM при импорте можно выполнять триггеры OnInsert, Validate тем самым поддерживая целостность данных без особых затрат. Настраивается все легко.
Пдробнее
http://www.pbiz.ru/DEM/navision_1s/navision_1s.htm