Мы тоже столкнулись с подобной проблемой при проверке и корректировки запасов в наличии.
Конкретно в этом механизме обнаружилась интересная бага, которая долго работает вроде над построением прогресс-бара.
При большом количестве номенклатуры время проверки-корректировки близилось к бесконечности.
Мы это дело поправили. Что точно там было и где - я уже не вспомню, т.к. не разработчик, и давно это было
.