Обычно пишем на X++, есть известные ограничения (
https://msdn.microsoft.com/EN-US/library/hh397320.aspx), а также неявные преобразования типов. В целом все предсказуемо и понятно, поддерживать легче. Переходить на C#, мне кажется, стоит только в случае ожидаемого большого ускорения кода или когда бОльшая часть Аксы сама перейдет на C#.
На практике, нововведения с внешними библиотеками в AX вызывают огромные лишние телодвижения (планирование мощности в сводном, расчеты в TMS), как в плане понять "как оно работает", так и в плане "а как это поменять?".