Опубликованы две статьи Вадима Гончаренко, посвященные повышению производительности Аксапты
Оптимизация запросов
http://axapta.mazzy.ru/hints/querytuning/
Index hints и MSSQL
http://axapta.mazzy.ru/hints/indexhints/
Компания Работа на Результат! предлагает услугу по повышению производительности Axapta и Navision
http://performance.rabota-na-rezultat.ru/