Околостоящие методологии с внедрением ИС -
библиотеки ITIL
http://itil.in.ua/ - разные статьи и полезности
Там же
http://itil.in.ua/index.php/books
Microsoft Operations Framework (MOF) версии 4 (русская версия)
набор рекомендаций, на основе которого можно разрабатывать процедуры, элементы управления и роли, необходимые для эффективной работы ИТ-инфраструктуры. MOF основан на стандарте ITIL (IT Infrastructure Library) и учитывает специфику платформы Майкрософт.
Блог о HelpDesk
http://www.helpdeski.ru/
В нашем применении - это всякие удобные Task Tracker'ы
Важно не забывать, что мы тут не только для того, что б просто сделать ИС (сам процесс), но и для того, что оно заработало и работало дальше (даже без нас).
Поэтому одной методологии только на процесс разработки софта - мало.